Składnik poznawczej restrukturyzacji CBT umożliwia osobie skorygowanie myślenia, które wywołuje emocje, takie jak lęk i złość lub poczucie niskiej samooceny. Terapeuta pomaga osobie zmienić jej myśli, emocje i zachowanie za pomocą rozumowania i logiki. CBT zachęca również osobę do większej pewności siebie i optymizmu poprzez wykorzystanie uznanych cech osoby z zespołem Aspergera, a mianowicie logiki i inteligencji. Pierwszym etapem jest ustalenie dowodów na konkretną myśl lub przekonanie. Osoby z zespołem Aspergera mogą dokonywać fałszywych założeń dotyczących ich sytuacji i intencji innych z powodu upośledzonych lub opóźnionych zdolności Teorii Umysłu. Mają też tendencję do dosłownej interpretacji, a zdawkowy komentarz może być wyrwany z kontekstu lub skrajnie. Na przykład, inne dziecko w szkole może mieć silne uczucia gniewu skierowane na dziecko z zespołem Aspergera i w upale chwili powiedzieć: „Jutro, kiedy przyjdziesz do szkoły, zabiję cię”. dziecko z zespołem Aspergera potrafi dosłownie interpretować to, co zostało powiedziane i obawiać się, że jutro może zostać zabite. Innym przykładem błędnej interpretacji uczuć lub intencji, tym razem dla uczuć, jest sytuacja, gdy pięcioletnia dziewczynka z zespołem Aspergera wróciła do domu ze szkoły, wyraźnie się czymś zaniepokojona i zaczęła pakować walizkę, nalegając, że wraz z matką opuściły miasto tego wieczoru. . W końcu jej matka odkryła, że powodem jej desperacji, by opuścić miasto, było to, że mały chłopiec w jej wieku podszedł do niej i powiedział: „Wyjdę za ciebie.” Istotnym i skutecznym elementem restrukturyzacji poznawczej jest rzucanie wyzwania pewne przekonania z faktami i logiką. Można podać informacje, które ustalają prawdziwe intencje innych osób i że statystyczne ryzyko konkretnego zdarzenia jest wysoce nieprawdopodobne i niekoniecznie śmiertelne. Wszyscy jesteśmy podatni na zniekształcone konceptualizacje, ale osoby z zespołem Aspergera są mniej zdolne do patrzenia na sprawy z odpowiedniej perspektywy, poszukiwania wyjaśnień lub rozważania alternatywnych wyjaśnień lub odpowiedzi. W CBT osobę zachęca się do większej elastyczności w myśleniu i szukania wyjaśnień za pomocą pytań lub komentarzy typu „Czy żartujesz?” lub „Jestem zdezorientowany tym, co właśnie powiedziałeś”. używane, gdy błędnie interpretujesz czyjeś intencje, na przykład „Czy jesteś poważny?” lub „Czy zrobiłeś to celowo?”, oraz w celu ratowania sytuacji po udzieleniu przez osobę niewłaściwej odpowiedzi, z komentarzem typu „Przepraszam, że obraziłem ty” lub „Och, co powinienem był zrobić?” Stephen Shore zadaje pytania typu „Widzę, że masz wyraz twarzy, ale nie jestem w stanie tego przeczytać. Czy jest coś, co powiedziałem, co cię niepokoi?”. Innym aspektem restrukturyzacji poznawczej jest zwiększenie zakresu konstruktywnych reakcji na konkretną sytuację. Niestety, dzieci i dorośli z zespołem Aspergera zwykle mają ograniczony zakres reakcji na sytuacje, które wywołują niepokój lub gniew. Terapeuta i dziecko tworzą listę właściwych i niewłaściwych reakcji oraz konsekwencje każdej reakcji. Można narysować różne opcje w postaci diagramu, który umożliwia dziecku określenie najbardziej odpowiedniej odpowiedzi w dłuższej perspektywie dla wszystkich uczestników.