Dziecko z zespołem Aspergera może mieć iloraz inteligencji sugerujący potencjał intelektualny do osiągania dobrych ocen w nauce, ale niektóre dzieci mają nietypowy profil zdolności uczenia się, który może obejmować specyficzne trudności w nauce i niższy niż oczekiwany poziom ocen (Manjiviona 2003). Nauczyciele i rodzice zgadzają się, że dziecko jest mądre, ale praca w szkole nie jest tak dobra, jak można by się spodziewać. Może to mieć bardzo szkodliwy wpływ na samoocenę dziecka. Istnieje kilka powodów, głównym wyjaśnieniem jest to, że dzieci z zespołem Aspergera często mają problemy z uwagą i funkcjami wykonawczymi. Być może najlepszym sposobem na zrozumienie pojęcia funkcji wykonawczej jest myślenie o dyrektorze naczelnym dużej firmy, który ma zdolność postrzegania „pełnego obrazu”, może rozważyć potencjalne skutki różnych decyzji, jest w stanie zorganizować zasoby i wiedzę, planować i ustalać priorytety w wymaganych ramach czasowych oraz modyfikować decyzje na podstawie wyników. Takie umiejętności wykonawcze mogą być znacznie opóźnione u dzieci i dorosłych z zespołem Aspergera.